Rotvarnarefni geta storknað eða afmengað prótein örvera og truflað þannig vöxt þeirra og æxlun.
Rotvarnarefni verka á frumuveggi og frumuhimnur örvera. Með því að trufla eða skemma frumuvegginn, eða trufla gangverk frumuveggmyndunar, valda þau leka innanfrumuefna eða hafa áhrif á himnu-tengd rafeindaflutningakerfi öndunarkeðjunnar og hafa þannig örverueyðandi áhrif.
Þeir verka á erfðaefni eða uppbyggingu erfðaagna og hafa þar með áhrif á afritun, umritun og þýðingu erfðaefnis og próteina.
Þeir verka á ensímkerfið í örverum, hindra ensímvirkni og trufla eðlileg efnaskipti þeirra.
